G. cuencana fue confundida con G. litonedis hasta 2018. Su reconocimiento resalta diferencias morfológicas y acústicas. Pertenece al subgénero Duellmania (sensu Duellman, 2015). Leyendas de figuras 3 y 4 en Carvajal-Endara et al. (2019) fueron intercambiadas por error.

La piel del dorso es finamente granular, no está co-ossificada con el cráneo y carece de crestas transversales. Los procesos supraciliares están ausentes. El anillo timpánico es débilmente granular a liso. La distancia interorbitaria es ligeramente mayor que el ancho del párpado superior. Los dedos I y II son aproximadamente iguales en longitud; el ancho de los discos es mayor que el de los dígitos. Los dedos no presentan membrana interdigital. La membrana interdigital entre los dedos externos se extiende hasta el tubérculo subarticular antepenúltimo del Dedo IV y hasta el tubérculo subarticular penúltimo del Dedo V. La tibia mide 39−50% de la LRC, ligeramente más corta que el pie. El talón carece de calcar o tubérculo.

Basado en un renacuajo nadador libre en estadio 38 del sur de Cuenca, 2579 m, Provincia Azuay. Longitud total 44.6 mm; longitud del cuerpo 17.3 mm (39% del total). Cuerpo ovoide y ligeramente deprimido; garganta ligeramente cóncava lateralmente. Ancho a nivel del espiráculo 11.5 mm; altura 9.3 mm. Ancho de cabeza 8.5 mm. Sistema lateral apenas visible. Líneas supraorbital e infraorbital paralelas al ojo; línea angular desciende verticalmente posterior al ojo; línea oral anterior desciende vertical desde disco oral hasta garganta. Dorso y línea media no visibles. Narina mediana, ovoide, sobresaliente, abertura anterolateral; distancia hocico–narina 2.3 mm; distancia internarial 2.4 mm. Ojo dirigido dorsalmente, diámetro 1.8 mm; interorbital 4.3 mm. Espiráculo sinistral a nivel medio del cuerpo; abertura posterior, distancia hocico–espiráculo 11 mm; tubo espiracular 3.1 mm de largo y 2.0 mm ancho. Tubo ventral dextral, 1.7 mm largo, 1.8 mm ancho. Cola 27.2 mm; musculatura caudal delgada, estrechándose hacia el extremo. Aletas caudales bien desarrolladas; altura máxima 9.3 mm; extremo redondeado. Disco oral pequeño, ventral, cerca del hocico, rodeado de papilas marginales uniseriales; fórmulas labiales 2/3(1). La longitud total varía de 42.3 mm (estadio 37) a 48.7 mm (estadio 39), proporción de cola ~61%. Papilas marginales variables (39–64). Dorso oliva-crema, flancos más claros; vientre gris oscuro; branquias rojizas visibles. Línea continua de marcas crema sobre musculatura caudal; mitad proximal rojizo-crema, mitad distal translúcida. Aletas dorsales y ventrales translúcidas con puntos crema dispersos. Iris dorado. Ontogenia: en estadio 41 dorsos y flancos marrón difuso con rayas paravertebrales gris-marrón; canthal y dorsolateral con raya gris-negra bordeada dorsalmente por línea crema; iris con tinte rojo. Estadio 46: marcas más definidas, raya lateral casi negra; dedos crema-amarillentos; pigmentación verde dispersa en rayas paravertebrales anteriores.