Pertenece al grupo Boana pellucens sensu Faivovich et al. (2005). Según Caminer y Ron (2020), quienes estudiaron secuencias de ADN, las poblaciones ecuatorianas similares a Boana pellucens del norte de Ecuador estaban más estrechamente relacionadas con B. rufitela de Panamá que con otras poblaciones ecuatorianas de B. pellucens, y pendientes de estudios adicionales, refieren los especímenes de B. pellucens de la Provincia Esmeraldas, Ecuador, a B. rufitela.

La cabeza es tan ancha como el cuerpo. El hocico es dos veces más largo que el ojo, plano, redondeado en perfiles dorsal y lateral, y apenas sobresale más allá del borde del labio. Las narinas son ligeramente protuberantes lateralmente. La región internarial está notablemente deprimida. El canthus rostralis es redondeado. La región loreal es cóncava. El pliegue supratimpánico es delgado, apenas ocultando el borde superior del tímpano. Anillo timpánico está presente, y el tímpano es distintivo. La pupila es horizontalmente elíptica. Presenta un pliegue ulnar. El pliegue dérmico en la muñeca es débil. Los dedos tienen discos redondos; el ancho del disco en el tercer dedo es igual a la longitud del tímpano. Los tubérculos subarticulares son pequeños y planos; el tubérculo distal en el cuarto dedo usualmente es bífido. Los tubérculos supernumerarios son diminutos, dispuestos en dos hileras en los segmentos proximales de los dedos. El tubérculo palmar es único. El prepollex está agrandado. La espina prepólica está presente en machos, curvada, proyectándose en algunos especímenes. No hay excrescencia nupcial. Los dedos tienen aproximadamente la mitad de membrana interdigital, excepto entre los dedos I y II, donde la membrana es vestigial. Hay un delgado pliegue dérmico transversal en el talón, y un pequeño espolón está presente. El tubérculo metatarsal interno es pequeño, elíptico, plano, visible desde arriba; el tubérculo metatarsal externo está ausente. Los tubérculos subarticulares son pequeños y redondos. Los tubérculos supernumerarios son diminutos, en una hilera en los segmentos proximales de los dedos. Los discos en los dedos de los pies son más pequeños que los de las manos. Los dedos de los pies tienen aproximadamente tres cuartos de membrana interdigital. La aleta anal es corta. Hay hileras verticales de tubérculos debajo de la abertura anal. La piel del vientre y las superficies posteroventrales proximales de los muslos es granular. La piel en otras superficies es lisa. Las hendiduras vocales son largas, extendiéndose desde la base midlateral de la lengua a lo largo del margen interno de la mandíbula casi hasta el ángulo de las mandíbulas. El saco vocal es único, mediano, subgular, moderadamente distensible.

Las larvas son desconocidas, pero se han descrito cambios ontogenéticos desde metamórficos hasta adultos.